研究發(fā)現(xiàn)人們對數千種人類蛋白質幾乎一無所知
(資料圖片)
一個被稱為unknome的蛋白質數據庫根據人們對蛋白質的了解程度對蛋白質進行排名,結果顯示,人們對數千種人類蛋白質幾乎一無所知,而其中一些蛋白質對生存至關重要。8月8日,相關成果發(fā)表于《科學公共圖書館—生物學》。
為了創(chuàng)造unknome數據庫,英國劍橋大學MRC分子生物學實驗室的Sean Munro和同事從人類身上發(fā)現(xiàn)的大約2萬個蛋白質基因入手。他們將密切相關的、可能具有相似功能的人類基因或蛋白質組合在一起,產生了大約7500個蛋白質簇。
接下來,他們將在老鼠或果蠅等常見研究動物中發(fā)現(xiàn)的密切相關的蛋白質添加到這些蛋白質簇中,因為這些蛋白質可能也具有相同功能。然后,他們根據基因功能主要信息庫中的條目數量,給每個蛋白質簇打分。
一種沒有被直接研究過的人類蛋白質,如果其在另一種動物身上的等效蛋白質得到了充分研究,它的得分仍然很高。如果蛋白質在被認為更可靠的條目中出現(xiàn)也會得到更高的分數,比如發(fā)表在期刊上。 Munro坦言,這種評分有些武斷,但在試圖弄清人們未知的東西時,這是不可避免的。
一些蛋白質被研究得十分透徹,因此其得分遠遠超過100。例如,一種參與胚胎發(fā)育的名為音猬因子的蛋白質得分為168,而幫助阻止細胞癌變的蛋白質p53得分為126。然而,仍有超過2200種蛋白質的得分低于2、1100種低于1、超過800種為0。
理論上,這些得分低的蛋白質可能沒有被研究過,因為它們沒有任何重要的作用。為了解這些蛋白質是否重要,研究小組使用了一種名為RNA干擾的技術,降低果蠅中260種得分低于1的蛋白質的水平。在60個案例中,果蠅死亡,這表明這些特殊的蛋白質具有重要的功能。
Munro說,這對研究果蠅的團隊成員來說是一個很大的驚喜。“他們只是假設已經找到了所有可能的重要基因,事實證明并非如此?!?/p>
他說,未知蛋白質的數量正在慢慢減少,但他希望加快發(fā)現(xiàn)的步伐。目前的問題是,資助機構和研究人員都不愿意冒險研究未知蛋白質,因為他們擔心相關的研究工作無足輕重從而無回報。
“甚至可能有我們不知道的生物過程,但沒有人在尋找與這一過程有關的蛋白質,因為沒有人知道它們?!盡unro說,這聽起來可能令人驚訝,但被稱為CRISPR的基因編輯技術是基于細菌蛋白質的,后者的功能直到2012年才被發(fā)現(xiàn)。
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