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近日，中國農業(yè)科學院作物科學研究所水稻優(yōu)異種質資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用創(chuàng)新團隊在基因組層面解析了我國黔東南香禾糯的遺傳演化規(guī)律及基因組印記，闡明了侗族族源及遷徙路線，為研究人類文明和遷徙模式提供了一種新思路，并為未來高產和抗逆等水稻育種提供了有價值的基因組數據和資源。相關研究成果發(fā)表在《分子植物》(《Molecular Plant》)上。

基因組層面揭示我國黔東南香禾糯遺傳演化規(guī)律。

人類遷徙活動是影響水稻遺傳演化的重要因素之一。侗族是中國古老的稻作民族之一，目前民族學和歷史學界對其族源及遷徙路線研究仍是學說各異。香禾糯是受侗族傳統飲食及農耕文化影響而被持續(xù)種植利用上千年的一類特殊生態(tài)型地方稻種，解析香禾糯優(yōu)異特性形成的遺傳機制不僅對育種利用有重要意義，根據香禾糯遺傳演化規(guī)律揭示侗族的起源和遷徙更是一項具有創(chuàng)新思路的研究工作。

該研究團隊利用香禾糯和長江流域以南地方稻種，從基因組層面揭示香禾糯起源于廣西、廣東、福建和江西;結合民族學證據研究表明，后續(xù)香禾糯隨侗族祖先的遷徙而傳入黔東南。香禾糯與上述省份地方稻種之間存在顯著的基因滲入，預示著人類活動的干預。因此，該研究從基因組層面推測侗族族源來自于廣西、廣東、福建和江西，同時從香禾糯的多次基因交流和滲入揭示侗族在歷史上發(fā)生了多次遷徙事件。

該研究發(fā)現約350年前香禾糯與祖先群體發(fā)生遺傳分化，其有效群體規(guī)模約220-150年前達到頂峰;約150-120年前、30年前遭遇了馴化瓶頸，有效群體規(guī)模大幅下降，這分別與黔東南歷史上的“糯改粘”政策及雜交水稻大面積推廣事件相吻合。此外，基因組印記揭示香禾糯農藝性狀相關關鍵基因GS3、Hd1和DPS1以及耐冷相關關鍵基因LTG1和MYBS3是侗族選擇馴化的目標基因，其單倍型變化模式為香禾糯馴化動態(tài)過程提供了遺傳證據。該研究還發(fā)掘了一個穗粒數相關基因，可能對水稻增產發(fā)揮重要作用。

(中國農業(yè)科學院作物科學研究所供圖)

關鍵詞： 群體規(guī)模 關鍵基因 中國農業(yè)科學院 作物科學