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八倍體野生草莓起源和遺傳分化之謎揭示


【資料圖】

草莓具有重要的經(jīng)濟(jì)和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。27日,記者從中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所獲悉,該所聯(lián)合國(guó)內(nèi)外研究人員,通過解析八倍體野生草莓基因組圖譜,研究了從野生親緣到栽培草莓的基因組多樣性,闡明了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關(guān)研究在線發(fā)表于著名國(guó)際期刊《自然·植物》。

研究示意圖。中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所供圖

現(xiàn)代八倍體栽培草莓起源于兩個(gè)八倍體野生種弗州草莓和智利草莓的種間雜交。然而,由于草莓屬系統(tǒng)發(fā)育解析涉及未知的祖先,同源染色體交換和不完全譜系分選等問題,學(xué)術(shù)界至今對(duì)八倍體草莓的二倍體祖先的問題仍存在較大的爭(zhēng)議。此外,對(duì)于八倍體草莓在馴化過程中的亞基因組的同源偏向性表達(dá)及轉(zhuǎn)變模式并不明確。

此項(xiàng)研究中,中國(guó)西南野生生物種質(zhì)資源庫云南省作物野生近緣種現(xiàn)代組學(xué)朱安丹專題組,與美國(guó)內(nèi)布拉斯加大學(xué)教授杰弗里·莫爾和云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究所研究員阮繼偉合作,提出了一套適用于多倍體的研究方法,構(gòu)建了智利草莓和弗州草莓兩個(gè)八倍體野生草莓染色體水平的高質(zhì)量分型基因組,并完成了八倍體草莓亞基因組的分離。

在此基礎(chǔ)上,研究團(tuán)隊(duì)還采用不同的分析方法,重新追溯了八倍體草莓的二倍體祖先,糾正了國(guó)外學(xué)者在亞基因組分配上錯(cuò)誤;并進(jìn)一步確定,森林草莓和飯沼草莓是八倍體草莓現(xiàn)存的二倍體祖先種。

此項(xiàng)研究還探討了八倍體草莓在馴化過程中的同源偏向性表達(dá)分化,并基于空間四聯(lián)體方法,完成了八倍體草莓的靜態(tài)和動(dòng)態(tài)的同源偏向性分析,并鑒定到了一些重要的轉(zhuǎn)錄因子在馴化過程中發(fā)生了表達(dá)偏倚及轉(zhuǎn)變。

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